袋式除塵器通常是一次為一個分室清灰，在該分室內一次清一行除塵布袋。由PLC控制袋式除塵器的清灰周期，清灰是自動在各分室順序行進的，可以由壓差信號啟動，也可以由可調時間周期啟動，或者由人工啟動。袋式除塵器的控制邏輯一次確定所有提升閥的動作。
在一個分室內，清灰過程由局部定時器控制。此定時器控制每次脈沖的持續時間和兩次脈沖之間的時間。除塵器各分室可在線清灰也可以離線清灰。離線清灰開始時先關上出口提升閥，話費十秒鐘，以免再有含塵氣體進入該室。其后是短暫的精致期。接著各個電磁閥順序啟動，一次一個，脈沖一行濾袋。一般，把定時器調節為在各個電磁閥起動之間間隔十秒。
所有閥門動作后，出現第二個靜止期，在此期間讓灰塵沉降入該分室的灰斗。在此靜止后，該分室的清灰周期總共花費180秒。
在各分室之間應當有可調的清灰停止期。開始時應當把這設定為至少十秒。如果某個室由于維修等原因不工作，就跳過，不清灰。